Trường THCS Bình Mỹ nằm hiền hòa bên dòng sông Hậu, một nhánh sông Cửu Long tọa lạc trên quốc lộ 91, thuộc ấp Bình Hưng, xã Bình Mỹ, huyện Châu Phú, tỉnh An Giang. Xã Bình Mỹ thuộc địa bàn nông thôn, kinh tế xã hội phát triển khá tốt trong đó lĩnh vực kinh tế nông nghiệp là chủ yếu, các ngành nghề tiểu thủ công nghiệp không nhiều, chủ yếu là sản xuất gạch ngói ở 3 ấp Bình Trung, Bình Thành và Bình Tân. Đời sống kinh tế xã hội của cộng đồng dân cư khá cao so với một số địa bàn khác trong huyện. Kể từ năm 1972, trường Trung học tỉnh hạt Bình Mỹ được hình thành. Qua nhiều lần thay tên, thay đổi địa điểm, tách nhập. Đến năm 2003, trên cơ sở tách học sinh THCS ra từ trường THPT Bình Mỹ, trường THCS Bình Mỹ được thành lập trở lại theo quyết định số 504/QĐ-UB ngày 17 tháng 7 năm 2003 của UBND huyện Châu Phú. Trường tọa lạc trên địa bàn ấp Bình Trung, xã Bình Mỹ.